期刊简介

               《现代肿瘤医学》(ISSN1672-4992,CN61-1415/R,月刊)是国家科技部、新闻出版署批准国内外公开发行的国家级肿瘤专业学术期刊,中国抗癌协会系列期刊。本刊系科技部中国科技论文统计源期刊、中国科技核心期刊、《中国学术期刊综合评价数据库》统计源期刊;美国《化学文摘》、《中国科学引文数据库》、《中国期刊网》、《中国学术期刊(光盘版)全文数据库》、《中国核心期刊(遴选)数据库》、《中国生物医学文献数据库》收录期刊;《万方数据-数字化期刊群》全文上网期刊;《CAJ-CD规范》执行优秀期刊。刊物主要介绍当前肿瘤学领域的最新成果及国内外肿瘤诊疗技术的新进展,新动向;刊登肿瘤基础研究,临床诊断、治疗方面的成果以及有创新性,科学性的新方法、新发明、新经验,努力为肿瘤学术交流及学科发展服务。主要栏目有专题专稿、论著、基础研究、临床报道、综述、流行病学、短篇报道、经验交流、中西医结合、护理园地等。                

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  • 杂志名称:现代肿瘤医学杂志
  • 主管单位:陕西省科学技术协会
  • 主办单位:中国抗癌协会 陕西省抗癌协会 陕西省肿瘤防治研究所 陕西省医学会
  • 国际刊号:1672-4992
  • 国内刊号:61-1415/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美), 万方收录(中), 知网收录(中), 维普收录(中), 上海图书馆馆藏
现代肿瘤医学杂志2018年第08期

生物信息学分析沉默HIF-1α后胃腺癌细胞系基因表达变化同胃腺癌发生发展的相关性研究

张峻;武月;赵岩;王跃;郑志超

关键词:胃腺癌, 缺氧诱导因子-1α, 生物信息学, 高通量测序
摘要:目的:探寻缺氧诱导因子-1α(hypoxia induced factor-1α,HIF-1 α)在表达和敲除的情况下胃腺癌细胞系中的基因表达特点,并揭示差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的相互作用.方法:从GEO数据库中下载基因表达谱数据GSE57200,共包括9个样本细胞株:4株导入空白对照的胃腺癌AGS细胞系和5株经慢病毒处理沉默HIF-1 α的AGS细胞系.对DEGs的富集分析采用了GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)数据库数据,蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络由Cytoscpe软件实现.结果:共筛选出DEGs 510个,GO主要富集在有机物反应、蛋白质代谢、细胞信号传导和细胞通信等,KEGG通路主要富集在谷胱甘肽代谢和细胞色素P450参与外来化合物代谢等.MAPK3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3又名extracellular regulated protein kinase 1,ERK1)是PPI得到的排名高的基因节点.MCODE模型显示DEGs主要与JAK/STAT传导通路、MEK/ERK传导通路相关,两者均与恶性肿瘤的侵袭转移密切相关.在胃腺癌细胞中HIF-1 α和MAPK3均呈过表达,通过感染慢病毒下调HIF-1α的表达后,MAPK3的表达也随之下调,两者正相关.结论:本研究在一定程度上揭示了在HIF-1 αc诱导下胃腺癌的发生发展,可能为后续胃腺癌相关的诊断和治疗提供有价值的分子靶标.